Miễn thuế TNDN 3 năm: Doanh nghiệp nào được hưởng ưu đãi này?

Việc hiểu rõ miễn thuế TNDN 3 năm đầu giúp doanh nghiệp nắm bắt đúng cơ hội tối ưu chi phí và cải thiện dòng tiền. Tuy nhiên, chính sách này được áp dụng theo nhóm đối tượng và điều kiện pháp lý cụ thể. Để tránh hiểu sai hoặc bỏ lỡ quyền lợi, bài viết sẽ trình bày điều kiện doanh nghiệp được hưởng ưu đãi miễn thuế TNDN 3 năm và cách xác định thời điểm áp dụng theo quy định hiện hành.
 

1. Điều kiện để doanh nghiệp được miễn thuế TNDN trong 3 năm đầu

Khi xem xét chính sách miễn thuế, điều quan trọng nhất là doanh nghiệp phải nắm rõ căn cứ pháp lý và phạm vi áp dụng. Đây là ưu đãi có tác động trực tiếp đến chi phí vận hành và khả năng tái đầu tư trong giai đoạn đầu thành lập. Vì vậy, việc hiểu chính xác điều kiện hưởng ưu đãi là bước mà bất kỳ doanh nghiệp nào cũng cần ưu tiên.

Trước hết, cần căn cứ vào quy định pháp luật hiện hành. Về vấn đề này, Bộ Tài chính có ý kiến như sau:

Tại khoản 4 Điều 10 Nghị quyết số 198/2025/QH15 về cơ chế, chính sách đặc biệt phát triển kinh tế tư nhân quy định:

Hỗ trợ thuế, phí, lệ phí

1. Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong thời hạn 02 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 04 năm tiếp theo đối với thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo của doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, công ty quản lý quỹ đầu tư khởi nghiệp sáng tạo, tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp đổi mới sáng tạo. Việc xác định thời gian miễn, giảm thuế thực hiện theo quy định của pháp luật về thuế thu nhập doanh nghiệp.
2. Miễn thuế thu nhập cá nhân, thuế thu nhập doanh nghiệp đối với khoản thu nhập từ chuyển nhượng cổ phần, phần vốn góp, quyền góp vốn, quyền mua cổ phần, quyền mua phần vốn góp vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo.
3. Miễn thuế thu nhập cá nhân trong thời hạn 02 năm và giảm 50% số thuế phải nộp trong 04 năm tiếp theo đối với thu nhập từ tiền lương, tiền công của chuyên gia, nhà khoa học nhận được từ doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, trung tâm nghiên cứu phát triển, trung tâm đổi mới sáng tạo, tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp đổi mới sáng tạo.
4. Miễn thuế thu nhập doanh nghiệp cho doanh nghiệp nhỏ và vừa trong 03 năm kể từ ngày được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu.

Dựa trên quy định trên, có thể thấy rằng mọi doanh nghiệp nhỏ và vừa (bao gồm cả doanh nghiệp hoạt động trong các lĩnh vực đặc thù như kinh doanh trang thiết bị vật tư y tế hoặc xây dựng phần mềm chuyển đổi số cho các đơn vị y tế) đều thuộc nhóm thụ hưởng chính sách ưu đãi này.

Tham khảo: Nghị quyết 198/2025/QH15: Những điểm nổi bật cần nắm được

Các trường hợp doanh nghiệp vừa và nhỏ đăng ký kinh doanh lần đầu không được miễn thuế TNDN 3 năm

Không phải mọi trường hợp “đăng ký kinh doanh lần đầu” đều được công nhận là tạo lập mới để hưởng ưu đãi miễn thuế TNDN 3 năm.

Theo khoản 3 Điều 6 dự thảo Nghị định hướng dẫn Nghị quyết 198/2025/QH15, các trường hợp sau không được coi là thành lập mới:

(1) Doanh nghiệp thành lập mới do các hình thức sau:

• Sáp nhập
• Hợp nhất
• Chia
• Tách
• Chuyển đổi chủ sở hữu
• Chuyển đổi loại hình doanh nghiệp

(2) Doanh nghiệp thành lập mới nhưng có yếu tố “liên đới doanh nghiệp cũ”

Doanh nghiệp không được xem là thành lập mới nếu:

• Người đại diện theo pháp luật (trừ trường hợp người đại diện không phải thành viên góp vốn) 
• Thành viên hợp danh
• Người có số vốn góp cao nhất

… đã tham gia hoạt động kinh doanh với vai trò tương tự ở một doanh nghiệp khác đang hoạt động hoặc đã giải thể nhưng chưa đủ 12 tháng, tính từ thời điểm giải thể doanh nghiệp cũ đến thời điểm thành lập doanh nghiệp mới.

Vậy doanh nghiệp nhỏ và vừa được xác định như thế nào?

Căn cứ Điều 4 Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa năm 2017

Luật quy định rõ nguyên tắc xác định doanh nghiệp nhỏ và vừa như sau:

Doanh nghiệp nhỏ và vừa bao gồm:

• Doanh nghiệp siêu nhỏ
• Doanh nghiệp nhỏ
• Doanh nghiệp vừa

Và phải đáp ứng cả hai điều kiện sau:

• Số lao động tham gia bảo hiểm xã hội bình quân năm không vượt quá 200 người

Đồng thời đáp ứng ít nhất một trong hai tiêu chí:

• Tổng nguồn vốn không vượt quá 100 tỷ đồng
• Tổng doanh thu năm trước liền kề không vượt quá 300 tỷ đồng

Ngoài ra, việc phân loại còn được thực hiện theo từng lĩnh vực hoạt động, bao gồm:

• Nông nghiệp - Lâm nghiệp - Thủy sản
  Công nghiệp - Xây dựng
• Thương mại - Dịch vụ

Đây là căn cứ quan trọng để xác định doanh nghiệp có thuộc đối tượng được miễn thuế TNDN 3 năm hay không.

Căn cứ Điều 5 Nghị định 80/2021/NĐ-CP quy định chi tiết tiêu chí xác định các loại Doanh nghiệp vừa và nhỏ như sau:

Thuế sai 1 ly, phạt đi cả chục triệu. Nếu bạn không chắc doanh nghiệp mình thuộc diện miễn/giảm thuế, thời điểm áp dụng, hay cách kê khai đúng theo luật thì rủi ro bị truy thu, phạt chậm nộp là hoàn toàn có thể xảy ra. Hãy để đội ngũ tư vấn thuế của Ecomtax như một người bạn đồng hành hướng dẫn bạn áp dụng đúng quy định thuế, tránh sai sót và rủi ro pháp lý không đáng có.

2. Thời điểm áp dụng chính sách miễn thuế TNDN trong 3 năm

Để xác định thời điểm doanh nghiệp nhỏ và vừa được hưởng chính sách miễn thuế TNDN 3 năm, cần căn cứ trực tiếp vào quy định tại dự thảo Nghị định hướng dẫn Nghị quyết 198/2025/QH15. Đây là cơ sở pháp lý xác định thời điểm bắt đầu áp dụng chính sách miễn thuế. 

Theo khoản 3 Điều 6 và khoản 2 Điều 15 dự thảo Nghị định hướng dẫn Nghị quyết 198/2025/QH15 có quy định về thời điểm áp dụng chính sách miễn thuế TNDN tròng 3 năm như sau:

Trích khoản 3 Điều 6 dự thảo Nghị định hướng dẫn Nghị quyết 198/2025/QH15

3. Doanh nghiệp nhỏ và vừa đăng ký kinh doanh lần đầu không bao gồm doanh nghiệp thành lập mới do sáp nhập, hợp nhất, chia, tách, chuyển đổi chủ sở hữu, chuyển đổi loại hình doanh nghiệp; doanh nghiệp thành lập mới mà người đại diện theo pháp luật (trừ trường hợp người đại diện theo pháp luật không phải là thành viên góp vốn), thành viên hợp danh hoặc người có số vốn góp cao nhất đã tham gia hoạt động kinh doanh với vai trò là người đại diện theo pháp luật, thành viên hợp danh hoặc người có số vốn góp cao nhất trong các doanh nghiệp đang hoạt động hoặc đã giải thể nhưng chưa được 12 tháng tính từ thời điểm giải thể doanh nghiệp cũ đến thời điểm thành lập doanh nghiệp mới:

a) Được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 03 năm kể từ khi được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu;

b) Thời gian miễn thuế được tính liên tục từ năm đầu tiên được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu;

c) Quy định ưu đãi tại khoản này không áp dụng đối với thu nhập quy định tại khoản 3 Điều 18 Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 67/2025/QH15.

Trích khoản 2 Điều 15 dự thảo Nghị định hướng dẫn Nghị quyết 198/2025/QH15

2. Quy định tại khoản 1, khoản 3 Điều 6 và Điều 8 Nghị định này có hiệu lực từ ngày Nghị quyết số 198/2025/QH15 ngày 17 tháng 5 năm 2025 của Quốc hội về một số cơ chế, chính sách đặc biệt phát triển kinh tế tư nhân có hiệu lực thi hành và áp dụng kể từ kỳ tính thuế năm 2025.

Điều này đồng nghĩa rằng chính sách miễn thuế TNDN 3 năm đầu dành cho doanh nghiệp nhỏ và vừa sẽ:

• Có hiệu lực từ ngày 17/5/2025
• Áp dụng bắt đầu từ kỳ tính thuế năm 2025

Tham khảo: Luật thuế TNDN 2025: Điểm mới quan trọng doanh nghiệp cần biết

Việc hiểu chính xác quy định miễn thuế TNDN 3 năm không chỉ giúp doanh nghiệp tránh sai sót mà còn tạo lợi thế cạnh tranh trong những năm đầu thành lập. Bên cạnh đó, sự chủ động nắm bắt thông tin và theo dõi quy định về thuế mới nhất sẽ giúp doanh nghiệp yên tâm hơn khi lập kế hoạch kinh doanh và quản trị dòng tiền.

EcomTax thuộc hệ sinh thái Nhanh.vn, mang đến bộ giải pháp toàn diện từ thuế, kế toán, hóa đơn điện tử đến vận hành kho - hỗ trợ doanh nghiệp quản lý minh bạch, tiết kiệm thời gian và tuân thủ đúng quy định pháp luật.

- Các thông tin giải đáp và tư vấn ở trên được chúng tôi cung cấp cho khách hàng của Nhanh.vn. Nếu quý khách có bất kỳ câu hỏi nào hay cần hỗ trợ, vui lòng liên hệ qua email: contact@nhanh.vn  
- Nội dung bài viết này chỉ nhằm mục đích tham khảo thông tin; 
- Xin lưu ý các điều khoản được đề cập có thể đã hết hiệu lực tại thời điểm bạn đang đọc.